Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RABEP1Q15276 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms