Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPRRQ15256 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PTPRRQ15256 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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