Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
GAPVD1Q14C86 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GAPVD1Q14C86 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
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