Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNTB1Q13884 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms