Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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