Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLN3Q13286 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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