Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM28Q13263 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM28Q13263 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM28Q13263 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM28Q13263 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM28Q13263 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM28Q13263 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM28Q13263 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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