Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHAF1AQ13111 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHAF1AQ13111 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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