Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRJQ12913 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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