Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIN2AQ12879 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIN2AQ12879 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
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