Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms