Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM27E3Q08E93 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms