Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB2Q08289 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB2Q08289 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB2Q08289 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB2Q08289 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB2Q08289 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms