Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms