Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAX8Q06710 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms