Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK3Q00526 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDK3Q00526 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms