Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms