Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABP4P57796 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABP4P57796 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABP4P57796 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABP4P57796 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABP4P57796 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABP4P57796 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms