Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms