Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms