Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP11P51784 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP11P51784 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP11P51784 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP11P51784 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP11P51784 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP11P51784 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP11P51784 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP11P51784 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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