Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LHX2P50458 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LHX2P50458 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LHX2P50458 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms