Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRIM1P49642 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRIM1P49642 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms