Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX1P48742 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX1P48742 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX1P48742 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LHX1P48742 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LHX1P48742 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LHX1P48742 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LHX1P48742 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms