Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATRXP46100 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATRXP46100 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATRXP46100 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATRXP46100 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATRXP46100 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATRXP46100 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRXP46100 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRXP46100 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms