Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRPPRCP42704 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRPPRCP42704 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms