Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ATP5C1P36542 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ATP5C1P36542 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms