Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNGA1P29973 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms