Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RXRBP28702 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RXRBP28702 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RXRBP28702 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRBP28702 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RXRBP28702 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RXRBP28702 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RXRBP28702 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RXRBP28702 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms