Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRGP23470 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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