Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NF1P21359 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NF1P21359 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NF1P21359 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NF1P21359 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NF1P21359 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NF1P21359 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NF1P21359 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms