Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALM1P0DP23 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms