Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms