Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SERPIND1P05546 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SERPIND1P05546 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms