Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRP5O75197 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRP5O75197 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRP5O75197 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRP5O75197 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRP5O75197 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRP5O75197 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRP5O75197 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRP5O75197 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRP5O75197 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRP5O75197 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRP5O75197 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms