Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNND1O60716 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms