Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
EDIL3O43854 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EDIL3O43854 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms