Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTIFO43310 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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