Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.155e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 AC009041.2-207ENST00000565069 813 ntTSL 315.71■□□□□ 0.115e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.15e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 SSBP4-210ENST00000601444 427 ntTSL 515.66■□□□□ 0.15e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.085e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.065e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 AC009041.2-205ENST00000565467 3726 ntTSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.055e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 C19orf24-203ENST00000485191 1675 ntTSL 215.35■□□□□ 0.055e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.045e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.045e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 CBX8-204ENST00000485449 581 ntTSL 315.27■□□□□ 0.045e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 215.14■□□□□ 0.014e-7■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 CBX8-203ENST00000427800 665 ntTSL 215.07■□□□□ 05e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.035e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.064e-7■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.085e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 AC009041.2-208ENST00000563837 705 ntTSL 214.46□□□□□ -0.095e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TXNRD2-220ENST00000634537 1086 ntTSL 514.37□□□□□ -0.114e-7■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.29□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.135e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.165e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 FBXW4-202ENST00000457105 630 ntTSL 514.02□□□□□ -0.175e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-215ENST00000637290 2009 ntTSL 513.81□□□□□ -0.25e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.235e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 CBX8-202ENST00000413392 777 ntTSL 313.58□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 LMF1-203ENST00000545827 2731 ntTSL 213.53□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-210ENST00000636131 2365 ntTSL 513.51□□□□□ -0.255e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.285e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TGM2-206ENST00000474777 2287 ntTSL 1 (best)13.25□□□□□ -0.295e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.35e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.35e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.35e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.315e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.335e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PGF-204ENST00000555234 811 ntTSL 212.73□□□□□ -0.375e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PGF-207ENST00000556939 1125 ntTSL 212.73□□□□□ -0.375e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.385e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 LMF1-215ENST00000570014 882 ntTSL 512.64□□□□□ -0.395e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 AC110285.2-202ENST00000608155 414 ntTSL 512.63□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.395e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.45e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TGM2-204ENST00000468262 1862 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.415e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 ADSL-222ENST00000637669 1927 ntTSL 512.4□□□□□ -0.425e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PITPNM2-204ENST00000451868 1639 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 DGKQ-203ENST00000509465 4362 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.22□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 C19orf24-205ENST00000590269 751 ntTSL 312.03□□□□□ -0.485e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 NLRC5-221ENST00000543030 1894 ntTSL 511.74□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.545e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 DGKQ-202ENST00000502309 818 ntTSL 511.59□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.565e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 MX2-213ENST00000496774 827 ntTSL 311.38□□□□□ -0.595e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.595e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 NLRC5-228ENST00000545081 5832 ntTSL 211.25□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 DGKD-208ENST00000471764 270 ntTSL 211.15□□□□□ -0.625e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.645e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PGF-208ENST00000557748 875 ntTSL 210.91□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.675e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.685e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.715e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TBC1D8-209ENST00000487392 373 ntTSL 510.53□□□□□ -0.725e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.745e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.755e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 RAVER1-205ENST00000593136 500 ntTSL 510.27□□□□□ -0.775e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.775e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.775e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.785e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.785e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TXNRD2-221ENST00000635155 858 ntTSL 510.14□□□□□ -0.797e-7■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.795e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.795e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 FER1L4-212ENST00000616711 3353 ntTSL 510.01□□□□□ -0.815e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 RPS10-203ENST00000464218 615 ntTSL 59.85□□□□□ -0.835e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 NLRC5-211ENST00000538110 2656 ntTSL 59.84□□□□□ -0.835e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.835e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 INO80-205ENST00000558357 5503 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.845e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.845e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 SDCCAG3-210ENST00000481114 340 ntTSL 29.79□□□□□ -0.845e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 576 ntTSL 29.78□□□□□ -0.845e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 TUBGCP2-208ENST00000482278 3553 ntTSL 29.72□□□□□ -0.855e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 FER1L4-209ENST00000613061 3710 ntTSL 59.68□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 NLRC5-216ENST00000538930 1686 ntTSL 59.62□□□□□ -0.875e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 SNX8-204ENST00000435336 634 ntTSL 59.58□□□□□ -0.885e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 PLEKHG5-204ENST00000377732 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.895e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 NLRC5-214ENST00000538778 1019 ntTSL 39.48□□□□□ -0.895e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 AMPD2-208ENST00000469039 513 ntTSL 49.3□□□□□ -0.925e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 MX2-201ENST00000330714 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.935e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 RPS10-206ENST00000494077 781 ntTSL 29.19□□□□□ -0.945e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 NLRC5-201ENST00000262510 6822 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.945e-6■■■■□ 20.6
RBFOX2O43251 NLRC5-217ENST00000539144 6505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.965e-6■■■■□ 20.6
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 278.5 ms