Protein–RNA interactions for Protein: O15353

FOXN1, Forkhead box protein N1, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN1O15353 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXN1O15353 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN1O15353 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms