Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR1CO15160 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms