Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KR12 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KR12 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KR12 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KR12 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KR12 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KR12 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
J3KR12 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
J3KR12 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
J3KR12 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KR12 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KR12 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3KR12 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3KR12 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms