Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
E9PCH4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
E9PCH4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
E9PCH4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
E9PCH4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
E9PCH4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.56■■■□□ 2
E9PCH4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
E9PCH4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
E9PCH4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms