Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3BA8MYP8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3BA8MYP8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms