Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF22A3QJZ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms