Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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PTPRNQ16849 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRNQ16849 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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