Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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RPE65Q16518 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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RPE65Q16518 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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RPE65Q16518 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPE65Q16518 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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