Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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