Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMCO1Q147U7 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMCO1Q147U7 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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