Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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CKAP5Q14008 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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CKAP5Q14008 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CKAP5Q14008 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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